Solution de reséquençage ciblé AmpliSeqMC pour Illumina
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Préparation de librairie | Séquençage | Analyse de données | Soutien Solution de reséquençage ciblé AmpliSeqMC pour Illumina Une solution de séquençage d’amplicons adaptable et simplifiée produisant des données d’une grande fiabilité à partir d’échantillons d’ADN et d’ARN à faible entrée. Points forts • Données exactes pour les divers types d’échantillons Combinaison de la chimie AmpliSeq et de la technologie de séquençage Illumina éprouvées pourobtenirdes données de grande qualité, même à partirde matière de départ de faible qualité, comme les tissus FFPE • Portefeuille complet de contenu Large gamme d'options et de contenustestéset prêts à utiliser pour les conceptions personnalisées • Flux de travail simple et rapide Amélioration de l'efficacité du laboratoire grâce au flux de travail de préparation de librairies rapide, nécessitant moins de 1,5 heure de manipulations • Solution adaptable Multiples options de plateformes de séquençage, d'analyse de données et de soutien pour répondre à presque tous les besoins en matière de débit Introduction AmpliSeq pour Illumina propose une solution de reséquençage ciblé rapide etprécise qui permet aux chercheurs de passerde l'ADN ou de l'ARN aux appels de variants en deux jours et demi. La solution prise en charge comprend un contenu de panel sélectionné, un test de préparation de librairies basé sur la PCR, ainsi que la technologie éprouvée de séquençage nouvelle génération (SNG) d'Illumina et l'analyse conviviale des données (Figure 1, Tableau 1). Les résultats obtenus offrent la couverture uniforme et hautement précise nécessaire à la détection de variants à faible fréquence de façon fiable et constante. En tirant parti de la chimie de haute performance AmpliSeq, les chercheurs peuvent utiliserle test AmpliSeq pour Illumina pour concentrerleursétudessurdesgènes, des régionsou desvariants d'intérêt bien définis avec grande précision. Les utilisateurs peuvent tirer parti des panels préconçus prêts à utiliserou des panels communautaires, dont le contenu a été sélectionné par des experts, ou encore personnaliser un panel pour répondre à leurs besoins particuliers. Le test de préparation de librairies basé sur la PCR utilise des oligonucléotides pour amplifier les régions d'intérêt afin d'étudier les variants à simple nucléotide (SNV), les insertions/délétions (indels), les variations du nombre de copies (CNV) et lesfusionsde gènes. La chimie AmpliSeq permet de multiplexerde 12 à > 24 000 amplicons, de façon à capturer simultanément de multiples cibles en une seule réaction. AmpliSeq pour Illumina prend en charge les échantillons d'ADN et d'ARN et ne nécessite que 1 ng d'ADN ou d'ARN de grande qualité. Il permet de traiter les échantillons fixés au formol et imprégnés à la paraffine (FFPE), tels que lestissustumoraux préservés. La solution AmpliSeq pour Illumina est optimisée pour être utilisée avec la chimie de séquençage par synthèse (SBS) d'Illumina. Les librairies préparées peuvent être séquencées surtout système de séquençage Illumina, notamment les systèmes iSeqMC 100, MiniSeqMC, MiSeqMC et NextSeqMC. Analyse des données et annotation des variants De 5 à 7 heures Trousse Librairie PLUS AmpliSeq pour Illumina De 17 à 32 heures Systèmes iSeq, MiniSeq, MiSeq ou NextSeq Choisissez un panel AmpliSeq pour Illumina prêt à utiliser ou communautaire, ou concevez un panel personnalisé Local Run Manager, BaseSpace Sequence Hub, BaseSpace Variant Interpréter Figure 1 : Solution de reséquençage ciblé AmpliSeq pourlllumina

Préparation de librairie | S équ en çage | An alyse de don n ées | Soutien Tableau 1 : AmpliSeq pour Illumina en bref Paramètre Flux de travail basé sur la PCR Type d’échantillon Tissus FFPE, sang Type d’entrée d’experts sur le terrain, de bases de données organisées et de publications d’études évaluées par les pairs. Ces panels éliminent le temps et le travail requis pour sélectionner les cibles et optimiser le rendement. À l’heure actuelle, des panels sont offerts pour les études oncologiques et les études sur les maladies génétiques. La gamme de panels s’élargit continuellement....

Préparation de librairie | S équ en çage | An alyse de don n ées | Soutien La préparation des librairies commence par l’amplification de régions précises dans l’ADN ou l’ADNc d’entrée. Le reste des séquences de primers est digéré et les adaptateurs de séquençage sont ajoutés aux amplicons qui résultent du processus. La librairie est amplifiée et prête à être quantifiée, normalisée et regroupée préalablement au séquençage. En suivant cette méthode, il est possible de préparer plusieurs librairies en aussi peu que cinq heures. Multiples systèmes pour un débit modulable Les systèmes...